搜索结果: 1-15 共查到“计算机科学技术 蛋白”相关记录53条 . 查询时间(0.292 秒)
甘氨酸是中枢神经系统中重要的神经递质。在甘氨酸能神经元的抑制性突触中，甘氨酸通过激活甘氨酸受体，控制呼吸节律、肌张力、运动协调并参与中枢神经系统的早期发育；在谷氨酸能神经元的兴奋性突触中，甘氨酸作为共激动剂参与NMDA受体的激活，调控学习与记忆活动。突触间隙中的甘氨酸浓度由两种甘氨酸转运蛋白（glycine transporter,GlyT）GlyT1和GlyT2进行调控，以保证突触前和突触后活动...
我国学者首次利用AI方法准确模拟蛋白质“光学指纹”（图）
AI方法 光学指纹 分子动力学
2024/1/8
记者2024年1月8日从安徽大学获悉，该校人工智能学院叶盛教授、孙长银教授与中国科学技术大学江俊教授等合作，在国际上首次成功利用人工智能、分子动力学模拟和量子化学理论计算方法，高效准确地模拟了完整真实蛋白质的Amide Ⅱ区域红外光谱，为蛋白质的氢键动态学研究提供了坚实的理论和技术支持。相关研究成果日前发表在国际学术期刊《美国化学会志》上。
近日，信息工程学院李富义教授团队在蛋白酶特异性底物裂解位点预测方面取得重要研究进展，研究论文“ ProsperousPlus : a one-stop and comprehensive platform for accurate protease-specific substrate cleavage prediction and machine-learning model construct...
前沿丨人工智能学院计智伟课题组提出蛋白互作预测的语言模型（图）
计智伟课题组 蛋白互作预测 语言模型
2023/7/23
2023年7月21日，生物信息领域重要期刊Briefings in Bioinformatics在线发表了南京农业大学人工智能学院计智伟教授课题组的题为“HNSPPI: A Hybrid Computational Model Combing Network and Sequence Information for Predicting Protein-Protein Interaction”的研...
游离脂肪酸由以羧酸为末端的碳氢链组成，是人类和动物的主要能量来源，在许多细胞功能中扮演着重要的信号分子角色。中链脂肪酸是一类碳链长度为8-12个碳的羧酸，包括癸酸（C10）、十一酸（C11）和月桂酸（C12）以及它们的2-羟基或3-羟基形式（如3-OH-C12）。中链脂肪酸在能量代谢和炎症等方面发挥着重要作用。研究显示，3-OH-C12的产生与脂肪酸的β-氧化过程密切相关。当该过程发生紊乱时，血浆...
2023年3月14日，中国科学院深圳先进技术研究院袁曙光团队与南方科技大学张华威团队合作，在《自然-通讯》（Nature communications）上，在线发表了题为Cryo-EM structure of human heptameric pannexin 2 channel的研究论文。该研究揭示了Pannexin 2 （Panx2）ATP膜孔通道膜蛋白质的分子机理。
人工智能“自己”定制新蛋白质
人工智能 机器学习 蛋白质结构预测
2022/9/6
在过去两年中，机器学习彻底改变了蛋白质结构预测。现在，《科学》杂志上的3篇论文描述了蛋白质设计方面的革命：华盛顿大学医学院生物学家的研究表明，机器学习可比以前更准确、更快速地创建蛋白质分子。科学家们希望这一进步将带来更多新的疫苗、疗法、碳捕获工具和可持续生物材料。
G蛋白偶联受体（GPCRs）是真核生物中最大的一类膜蛋白，在感知胞外信号和介导胞内信息转导中发挥了重要作用，并参与调控多种生理过程，与人类疾病密切相关，是最重要的药物靶标蛋白家族。GPCR与第二信使环磷酸腺苷相关的信号通路中，主要通过刺激型G蛋白（Gs）和抑制型G蛋白（Gi）来区分细胞内不同的信号传递方式。了解受体对Gs和Gi信号通路的选择性机制是GPCR和相关信号转导领域长期以来的重要科学问题。
人类ABCD1属于ABC转运蛋白超家族ABCD亚家族，定位于过氧化物酶体膜上，能够利用ATP水解产生的能量将超长链脂酰辅酶A (VLCFA-CoA)从细胞质转运到过氧化物酶体中进行β-氧化。ABCD1功能缺陷会使得超长链脂肪酸在细胞中积累，导致伴X-染色体肾上腺脑白质营养不良症(X-ALD)（图1）。作为最常见的过氧化物酶体疾病，X-ALD在人群中的发病率约为1/17,000，影响人类的肾上腺、脊...
纳米黄金粒子“出手”——蚕丝变身超快蛋白质基忆阻器（图）
纳米黄金粒子 蚕丝 蛋白质 基忆阻器
2020/3/16
养蚕缫丝在我国历史悠久。作为一种古老的天然动物纤维，蚕丝包含纤维状蛋白质丝纤蛋白、无机物等成分，以其结构稳定、质量轻、质感柔、易翻新等特点，被广泛应用于家纺、医疗、美容等诸多领域。如今，科研人员尝试将常见的蚕丝制作成生物AI芯片植入人体内，让人工智能与大健康相结合。日前，发表在国际著名学术期刊《先进功能材料》上的一项成果，让这一梦想更近了一步。这项成果来自国家特聘教授、长江学者刘向阳的厦门大学团队...
近年来，蛋白质液液相分离（Liquid-liquid Phase Separation, LLPS）逐渐成为生物学研究的热点之一。它在生命体的正常代谢和疾病过程中都发挥着非常重要的作用。随着越来越多的探索LLPS具体发生机制的报道，人们发现影响蛋白质LLPS的因素主要来自于两个方面：一是蛋白质序列性质，如突变及翻译后修饰的影响；二是受到体系微环境，比如温度、蛋白质浓度、pH值、盐浓度、压力等的调节...
中国科学技术大学等利用人工智能预测蛋白质“光学指纹”（图）
中国科学技术大学 人工智能 蛋白质 光学指纹
2019/6/11
最近，中国科学技术大学微尺度物质科学国家研究中心教授江俊，与中国科大教授罗毅和美国加州大学尔湾分校教授Shaul Mukamel合作，通过利用人工智能机器学习中的神经网络技术，模拟了蛋白质肽键结构与性质之间的构效关系，将计算量一下降低了上万倍。最后他们成功地预测了肽键紫外光谱，还用随机森林的办法揭示了具有化学内涵的结构描述子和构效关系。人工智能与量子化学理论计算的结合，为预测蛋白质的光学特性提供了...
蛋白质是生命的基石，生物的功能依赖于既稳定而又灵活可变的蛋白质结构。蛋白质的光谱响应信号，尤其是紫外光谱，可以称之为蛋白质骨架的“指纹”。这个“光学指纹”，经过理论模拟的解读，可以揭示出精确的蛋白质结构，为生命科学和医学诊断提供极其重要的信息。然而，蛋白质的结构极其复杂多变，需要做大量的高精度的量子化学理论计算。由于计算量太大，即使是最厉害的超级计算机轻易也“吃不消”。所以蛋白质的光谱的理论解读是...
第三届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP-2014)顺利召开
第三届 中国计算蛋白质组学 研讨会
2014/12/26
2014年11月12日至13日，第三届中国计算蛋白质组学研讨会（CNCP-2014，China Workshop on Computational Proteomics）在中国科学院计算技术研究所盛大召开，160多位代表参加了本届会议。CNCP会议的主题是“计算蛋白质组学”。最近十年，随着蛋白质组研究的兴起，特别是用于蛋白质鉴定的质谱技术的快速发展，蛋白质组研究中产生的质谱数据规模越来越大，成为大...
对MS-Alignment算法进行分析得出该算法很难满足大规模数据对鉴定速度的要求，而且具有的一个特点是相同的任务在不同的数据上重复计算，为数据划分提供了基础。基于CUDA编程模型使用图形处理器(GPU)对步骤数据库检索及候选肽段生成进行加速优化，设计了该步骤在单GPU上的实现方法。测试结果表明，此方法平均加速比为30倍以上，效果良好，可以满足蛋白质翻译后修饰鉴定中大规模数据快速计算的需求。